Potravinářské silikonové hadičky se obecně nedoporučuje přicházet do přímého kontaktu s dezinfekčními prostředky. Přestože silikonové hadičky mohou v některých případech tolerovat určité chemikálie, dezinfekční prostředky často obsahují silné oxidanty, chloridy, alkoholy nebo jiné korozivní a reaktivní chemické složky, které mohou reagovat se silikonovým gelem a způsobit povrchovou korozi, ztvrdnutí, změnu barvy nebo snížení výkonu silikonové hadičky.
Například, ačkoli je reakce mezi hydroxidem sodným a silikonovým gelem při pokojové teplotě relativně mírná, může při vysokých teplotách podléhat prudké reakci, což ovlivňuje výkon silikonových hadiček. Podobně dezinfekční prostředky obsahující chlór, jako je chlornan sodný, mají silné oxidační vlastnosti a mohou poškodit chemickou strukturu silikagelu. Přestože jsou alkoholové dezinfekční prostředky méně dráždivé, dlouhodobé působení může mít na silikonový gel také nepříznivé účinky.
